אבוג'ן משיקה גרסה מתקדמת של הטכנולוגיה החישוביות שלה

לאיתור גנים - 0.ATHLETE™ 4
הגרסה החדשה של הטכנולוגיה מסתמכת על סדרה של כלים ואלגוריתמים ייחודיים, חדשים ומשופרים, המאפשרים להאיץ באופן משמעותי את יכולות גילוי הגנים של החברה באמצעות שילוב סוגים שונים של מידע מן הצמח

ישראל, רחובות - 4 באפריל 2201, אבוג'ן (סימול בת"א:אבגן), הפועלת בתחום של שיפור תכונות בצמחים באמצעות גנומיקה, הודיעה על השקת 0.ATHLETE™ 4, גרסה חדשה ומתקדמת של הטכנולוגיה שלה לאיתור גנים לשיפור תכונות בצמחים. עד כה, גילתה החברה באמצעות גירסאות קודמות של ה-ATHLETE™ וערכה ולידציה בצמחי מודל למעלה מ-3,000 גנים, העשויים להשפיע על תכונות מפתח בצמחים, כגון העלאת יבול, עמידות בתנאי גידול קשים, ניצול יעיל של דשן ועמידות בפני מזיקים של צמחים. פטנטים הוגשו ו/או נרשמו עבור כל הגנים הללו.

ATHLETE™ 4.0 מסתמכת על סדרה של כלים ואלגוריתמים ייחודיים, חדשים ומשופרים, המאפשרים להאיץ באופן משמעותי את יכולות גילוי הגנים של אבוג'ן באמצעות שילוב סוגים שונים של מידע מצמחים שונים.
בנוסף, ATHLETE™ 4.0 מאפשרת גילוי מקיף ומדויק יותר של גנים תוך השוואה בין מיני צמחים שונים, על סמך בסיסי מידע גנומיים, הכוללים למעלה מ-200 מינים שונים של צמחים ולמעלה מ-,000,0004 גנים.
כמו גם בגירסאות קודמות של ATHLETE™ , הגירסא החדשה נתמכת על-ידי תשתיות
(Information Technology) IT ייחודיות, אשר פותחו על-ידי אבוג'ן על-מנת לתמוך באחד מבסיסי נתוני
ה-Ag-Bio הגדולים ביותר בעולם.



ד"ר חגי קרחי סמנכ"ל פיתוח ו-CTO באבוג'ן מסר: " ATHLETE™ 4.0 מהווה מנוע עוצמתי, המאפשר לאבוג'ן ליצור ידע בעל ערך מתוך כמויות המידע העצומות, המיוצרות על ידי החברה במסגרת ניסויי שדה ייעודיים וממידע ציבורי, על מנת לבצע איתור גנים ממוקד ולספק לשותפינו, הנוכחיים והעתידיים, גנים באיכות גבוהה לשיפור תכונות רצויות בצמחים. כאחת החברות המובילות בעולם בתחום הגנומיקה בצמחים, היעד המרכזי שניצב בפני הצוות המדעי שלנו הינו להמשיך ולהשקיע משאבים ומאמצים בפיתוח יכולות חדשות ובשיפור היכולות הקיימות, זאת במקביל למאמצים השוטפים במסגרת שיתופי הפעולה שלנו עם חברות הזרעים המובילות בעולם. אנו גאים מאוד בהשקה של ATHLETE™ 4.0, המכילה מספר משמעותי של טכנולוגיות קנייניות חדשות ומשופרות ומהווה דוגמה להצלחה שלנו בהשגת יעדי החברה."


מבין המאפיינים החדשים של ATHLETE™ 4.0 :

 EvoCAT (Evogene Clustering & Assembly Toolbox) - ATHLETE™ 4.0 משלבת גרסה מתקדמת של טכנולוגיה קניינית חדשנית, עבור ריצוף והרכבת מקטעי ד.נ.א קצרים מתוך פלטפורמות ריצוף 'הדור הבא', המשפרת משמעותית את יכולת האינטגרציה למערכת של רצפים גנטיים שלמים. פלטפורמות 'הדור הבא' מייצרות כמות עצומה של מקטעי ד.נ.א קצרים (הקצרים פי 10 מהמקטעים בהם נעשה שימוש עד היום), המהווים אתגר משמעותי בעבודה עם רצפים גנטיים והפיכתם לקטעי גנים שלמים. כמענה לכך, EvoCAT מאפשרת התמודדות עם למעלה מפי 1,000 מקטעי ד.נ.א ורצפים, מהמקטעים בהם נעשה שימוש עד היום.



eTrait - ATHLETE™ 4.0 כוללת גרסא חדשה של פלטפורמה לאחסון וניתוח מידע פנוטיפי (מידע על המופע החיצוני של תכונות בצמח). גרסא חדשה זו מהווה צעד נוסף להשגת המטרה של אבוג'ן לפתח יכולות פנוטיפיות ממוחשבות מדויקות יותר בהשוואה ליכולת של הגרסה הקודמת של ATHLETE™, ואיסוף מידע ישירות מן השדה. המידע הפנוטיפי כולל תכונות שונות של צמחים הניתנות לכימות, כגון צבע עלה, מספר עלים וכו', המאוחסנים בפלטפורמה באופן אחיד ושיטתי על מנת לשמור על רמת תאימות נתונים גבוהה ולאפשר ניתוח סטטיסטי יעיל בנוסף למידע הגנומי שנאסף במקביל. מידע זה מאפשר גילוי מדויק ומהיר יותר של הגנים המשפיעים על שיפור התכונה.